Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc17Q9CXD9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc17Q9CXD9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms