Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psmd8Q9CX56 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms