Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxxc1Q9CWW7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxxc1Q9CWW7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms