Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhobtb3Q9CTN4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms