Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms