Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ifitm3Q9CQW9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifitm3Q9CQW9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Ifitm3Q9CQW9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ifitm3Q9CQW9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ifitm3Q9CQW9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ifitm3Q9CQW9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ifitm3Q9CQW9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ifitm3Q9CQW9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifitm3Q9CQW9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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