Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms