Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Znhit3Q9CQK1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Znhit3Q9CQK1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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