Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms