Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pole4Q9CQ36 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pole4Q9CQ36 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms