Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc18Q9CQ07 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms