Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg3Q9CPX6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms