Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lpin3Q99PI4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms