Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GpnmbQ99P91 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GpnmbQ99P91 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms