Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atoh8Q99NA2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms