Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac9Q99N13 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac9Q99N13 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms