Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ms4a6dQ99N07 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ms4a6dQ99N07 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms