Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ms4a4dQ99N05 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ms4a4dQ99N05 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms