Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel1Q99MW3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel1Q99MW3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel1Q99MW3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel1Q99MW3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramel1Q99MW3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms