Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KarsQ99MN1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KarsQ99MN1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms