Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms