Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnpo2Q99LG2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms