Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp16Q99LG0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms