Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms