Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms