Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apobec3Q99J72 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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