Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim7Q923T7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms