Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EedQ921E6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EedQ921E6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms