Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rpe65Q91ZQ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms