Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rrp1bQ91YK2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrp1bQ91YK2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms