Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ3

Thyn1, Thymocyte nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thyn1Q91YJ3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thyn1Q91YJ3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thyn1Q91YJ3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thyn1Q91YJ3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thyn1Q91YJ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thyn1Q91YJ3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thyn1Q91YJ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thyn1Q91YJ3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms