Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csde1Q91W50 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csde1Q91W50 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms