Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms