Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC82

Rhbdl1, Rhomboid-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl1Q8VC82 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rhbdl1Q8VC82 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl1Q8VC82 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl1Q8VC82 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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