Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc12Q8R344 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms