Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CipcQ8R0W1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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