Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hecw1Q8K4P8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hecw1Q8K4P8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hecw1Q8K4P8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms