Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OptnQ8K3K8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OptnQ8K3K8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms