Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prpf39Q8K2Z2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms