Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc12Q8K2L8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Trappc12Q8K2L8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms