Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms