Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Upp2Q8CGR7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Upp2Q8CGR7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms