Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrrc9Q8CDN9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc9Q8CDN9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc9Q8CDN9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms