Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RybpQ8CCI5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RybpQ8CCI5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms