Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Spef2Q8C9J3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spef2Q8C9J3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spef2Q8C9J3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms