Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska3Q8C263 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska3Q8C263 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms