Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C1R3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q8C1R3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q8C1R3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms