Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp47Q8BY87 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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Usp47Q8BY87 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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Usp47Q8BY87 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp47Q8BY87 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms