Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slx1bQ8BX32 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms