Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprnQ8BWU1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms